Protein–RNA interactions for Protein: Q99700

ATXN2, Ataxin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN2Q99700 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATXN2Q99700 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN2Q99700 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms