Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF3CQ99613 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3CQ99613 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms