Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SIN3AQ96ST3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms