Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK5RAP2Q96SN8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms