Protein–RNA interactions for Protein: Q96S96

PEBP4, Phosphatidylethanolamine-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEBP4Q96S96 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEBP4Q96S96 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEBP4Q96S96 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms