Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCC1Q96S66 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLCC1Q96S66 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms