Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms