Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHIPQ96QV1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms