Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARXQ96QS3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ARXQ96QS3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms