Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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