Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 423.6 ms