Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCEEQ96PE7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms