Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGLYRP2Q96PD5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms