Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ANKRD27Q96NW4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD27Q96NW4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms