Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms