Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms