Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMTD1Q96MG8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms