Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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SAMD8Q96LT4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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