Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT74Q96LB3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms