Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
EP400Q96L91 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms