Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPZA3Q96KX2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPZA3Q96KX2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms