Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms