Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DCHS1Q96JQ0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCHS1Q96JQ0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms