Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX3Q96JJ7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX3Q96JJ7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX3Q96JJ7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMX3Q96JJ7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMX3Q96JJ7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMX3Q96JJ7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMX3Q96JJ7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMX3Q96JJ7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMX3Q96JJ7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMX3Q96JJ7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms