Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC12Q96J65 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms