Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APIPQ96GX9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APIPQ96GX9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms