Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCD1Q96GM5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCD1Q96GM5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms