Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIPA1Q96FS4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIPA1Q96FS4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms