Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MALSU1Q96EH3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MALSU1Q96EH3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MALSU1Q96EH3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MALSU1Q96EH3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MALSU1Q96EH3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MALSU1Q96EH3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MALSU1Q96EH3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MALSU1Q96EH3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MALSU1Q96EH3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MALSU1Q96EH3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MALSU1Q96EH3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MALSU1Q96EH3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MALSU1Q96EH3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MALSU1Q96EH3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MALSU1Q96EH3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MALSU1Q96EH3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MALSU1Q96EH3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MALSU1Q96EH3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MALSU1Q96EH3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MALSU1Q96EH3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MALSU1Q96EH3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MALSU1Q96EH3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MALSU1Q96EH3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MALSU1Q96EH3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MALSU1Q96EH3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms