Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRRFQ96E11 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms