Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIFAQ96CG3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIFAQ96CG3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIFAQ96CG3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIFAQ96CG3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIFAQ96CG3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIFAQ96CG3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TIFAQ96CG3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIFAQ96CG3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIFAQ96CG3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIFAQ96CG3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIFAQ96CG3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIFAQ96CG3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIFAQ96CG3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIFAQ96CG3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIFAQ96CG3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIFAQ96CG3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIFAQ96CG3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TIFAQ96CG3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIFAQ96CG3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms