Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms