Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms