Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms