Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms