Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF25Q93038 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF25Q93038 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms