Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms