Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRN2Q92932 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRN2Q92932 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms