Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms