Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms