Protein–RNA interactions for Protein: Q92537

SUSD6, Sushi domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD6Q92537 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD6Q92537 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD6Q92537 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms