Protein–RNA interactions for Protein: Q92529

SHC3, SHC-transforming protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC3Q92529 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SHC3Q92529 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC3Q92529 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC3Q92529 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC3Q92529 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC3Q92529 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC3Q92529 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC3Q92529 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC3Q92529 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC3Q92529 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC3Q92529 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC3Q92529 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC3Q92529 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC3Q92529 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC3Q92529 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC3Q92529 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHC3Q92529 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHC3Q92529 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHC3Q92529 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHC3Q92529 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHC3Q92529 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms