Protein–RNA interactions for Protein: Q92393

TY1B-OR, Transposon Ty1-OR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-ORQ92393 YLL044WYLL044W 447 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 DUG3YNL191W 1074 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 YPL088WYPL088W 1029 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 FKS1YLR342W 5631 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 IXR1YKL032C 1794 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 MPH1YIR002C 2982 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 UBR2YLR024C 5619 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 DYN2YDR424C 279 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 DGR1YNL130C-A 147 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 YAT2YER024W 2772 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 NSA1YGL111W 1392 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 PTR3YFR029W 2037 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 RNA14YMR061W 2034 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 YPR053CYPR053C 456 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 YNL193WYNL193W 1677 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 PIK1YNL267W 3201 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 RSN1YMR266W 2862 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 YDR209CYDR209C 414 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 MRP8YKL142W 660 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 MRPL38YKL170W 417 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 TIF4631YGR162W 2859 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 YGR168CYGR168C 1131 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 YKT6YKL196C 603 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 CDC24YAL041W 2565 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 RPN4YDL020C 1596 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 RBK1YCR036W 1002 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 PDX1YGR193C 1233 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 SAE3YHR079C-A 276 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 YKL091CYKL091C 933 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 YIG1YPL201C 1386 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 TAF2YCR042C 4224 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 ERG9YHR190W 1335 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1B-ORQ92393 YHP1YDR451C 1062 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 MFM1YPL060W 1242 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 YKR015CYKR015C 1707 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 BRE1YDL074C 2103 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 YDR249CYDR249C 1122 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 YNR071CYNR071C 1029 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 ISU1YPL135W 498 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 UBP2YOR124C 3819 nt3.01□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 YKR051WYKR051W 1257 nt3.01□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 MIP6YHR015W 1980 nt3.01□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 RPS28BYLR264W 204 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 TRS130YMR218C 3309 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 SPI1YER150W 447 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 YHL037CYHL037C 402 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 CPR7YJR032W 1182 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 YAL065CYAL065C 387 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 MST28YAR033W 705 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 YPL142CYPL142C 318 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 YBR300CYBR300C 498 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 TEC1YBR083W 1461 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 RAD5YLR032W 3510 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 DNL4YOR005C 2835 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 YGL101WYGL101W 648 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 ARC19YKL013C 516 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 SAK1YER129W 3429 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 MET5YJR137C 4329 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 YCG1YDR325W 3108 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 YGR226CYGR226C 210 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 YAP7YOL028C 738 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 BUD21YOR078W 645 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 YPR147CYPR147C 915 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 FRM2YCL026C-A 582 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 CBP2YHL038C 1893 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 SXM1YDR395W 2835 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 RTN1YDR233C 888 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 YDR442WYDR442W 393 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 AIM19YIL087C 474 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 GCY1YOR120W 939 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 SUC2YIL162W 1599 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 FLO11YIR019C 4104 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 RRM3YHR031C 2172 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 GLN4YOR168W 2430 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 DYN1YKR054C 12279 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 ASP1YDR321W 1146 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 ADH4YGL256W 1149 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 LST7YGR057C 729 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 RPS31YLR167W 459 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 TVP18YMR071C 504 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 RPS11BYBR048W 471 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 CFT1YDR301W 4074 nt2.96□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 KAP104YBR017C 2757 nt2.96□□□□□ -1.93
TY1B-ORQ92393 SAP185YJL098W 3177 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1B-ORQ92393 SRS2YJL092W 3525 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1B-ORQ92393 YJR039WYJR039W 3366 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1B-ORQ92393 LAP2YNL045W 2016 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1B-ORQ92393 SIP1YDR422C 2448 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1B-ORQ92393 ERB1YMR049C 2424 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1B-ORQ92393 SKI3YPR189W 4299 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-ORQ92393 IZH1YDR492W 951 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-ORQ92393 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-ORQ92393 GTR1YML121W 933 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-ORQ92393 PCL7YIL050W 858 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-ORQ92393 MLH1YMR167W 2310 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1B-ORQ92393 YOR333CYOR333C 417 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1B-ORQ92393 ETP1YHL010C 1758 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1B-ORQ92393 LAA1YJL207C 6045 nt2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.6 ms