Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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