Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM8

SCFD1, Sec1 family domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCFD1Q8WVM8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SCFD1Q8WVM8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCFD1Q8WVM8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.7 ms