Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC7Q8WUI4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC7Q8WUI4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms