Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY8

IGDCC4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC4Q8TDY8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGDCC4Q8TDY8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGDCC4Q8TDY8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGDCC4Q8TDY8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGDCC4Q8TDY8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGDCC4Q8TDY8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGDCC4Q8TDY8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGDCC4Q8TDY8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
IGDCC4Q8TDY8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGDCC4Q8TDY8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGDCC4Q8TDY8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGDCC4Q8TDY8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGDCC4Q8TDY8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGDCC4Q8TDY8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGDCC4Q8TDY8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IGDCC4Q8TDY8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IGDCC4Q8TDY8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IGDCC4Q8TDY8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGDCC4Q8TDY8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms