Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3LQ8TDB6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms