Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC71

SPATA18, Mitochondria-eating protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA18Q8TC71 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPATA18Q8TC71 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA18Q8TC71 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA18Q8TC71 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA18Q8TC71 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA18Q8TC71 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA18Q8TC71 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA18Q8TC71 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA18Q8TC71 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA18Q8TC71 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA18Q8TC71 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA18Q8TC71 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA18Q8TC71 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA18Q8TC71 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA18Q8TC71 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA18Q8TC71 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA18Q8TC71 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA18Q8TC71 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA18Q8TC71 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA18Q8TC71 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA18Q8TC71 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA18Q8TC71 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA18Q8TC71 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA18Q8TC71 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA18Q8TC71 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA18Q8TC71 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA18Q8TC71 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms