Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms